Angermann, Cecile ORCID: 0000-0002-1051-5679 (2026). Protein-based seed germination: Conversion of proteins into carbohydrates, nitrogen compounds and energy during germination and seedling establishment of Lupinus albus. PhD thesis, Universität zu Köln.

[thumbnail of Dissertation_Lupin_CA_Publication.pdf] PDF
Dissertation_Lupin_CA_Publication.pdf - Submitted Version

Download (14MB)

Abstract

The need for resource-efficient crops is increasing due to climate change, resource scarcity and the growing demand for plant-based protein sources. In this context, white lupin (Lupinus albus) is a particularly promising crop. Due to its high protein content and ability to thrive on nutrient-poor soils thanks to its specialised root structures and symbiosis with nitrogen-fixing bacteria, this legume represents a sustainable production system with great developmental potential. However, realising this potential fully requires a detailed understanding of the molecular mechanisms that govern early seed development and nutrient utilisation. During germination, plant seeds are heterotrophic, relying mostly on their stored nutrients. L. albus is a protein crop, containing up to 40 % protein in its seeds, which act as the primary storage compound. The total seed proteome is made up of 85 % classical storage proteins, which act as reserves of carbon, nitrogen and sulfur. Our results indicated that these storage properties were maintained during germination, with the storage proteins remaining stable. Instead, lipids were used to fuel the germination. The protein fractions that were most mobilised during germination were those related to desiccation tolerance, such as LEA proteins, and storage lipids, such as oleosins. These were also highly abundant in seeds. Degradation of these proteins released large quantities of the amino acids alanine, glycine, and threonine. The catabolism of these amino acids provided the seed with pyruvate and glyoxylate. When combined with acetyl-CoA, a product of lipid β-oxidation, these intermediates were believed to fulfil a glyoxylate cycle bypass, providing the seed with the carbohydrates necessary for energy generation and biomass construction (see Chapter 2: Manuscript 1). We found that the mitochondria in the seeds of L. albus were dynamic, pre-assembled systems that contained all of the necessary respiratory complexes. During imbibition, the activation of cofactor biosynthesis, transport, and redox homeostasis enabled the immediate provision of energy. We identified NAD-dependent formate dehydrogenase as the third most abundant seed mitochondrial protein. The high abundance of this protein, in combination with those of other dehydrogenases involved in mitochondrial amino acid catabolism, suggests that seeds have specialised mitochondrial metabolism, providing energy and carbohydrate precursors while carrying out detoxification. Furthermore, our study revealed that a significant proportion of the mitochondrial proteins found in L. albus seeds were uncharacterised, with no close homologues identified in Arabidopsis. This suggests the existence of legume-specific mitochondrial adaptations (see Chapter 4: Manuscript 3). During the epigeal growth phase after germination, the cotyledons of L. albus were exposed to light and turned green. At this time, the degradation of storage proteins was intensified, leading in an increased concentration of free amino acids, particularly asparagine (see Chapter 2: Manuscript 1). The synthesis of the proteins necessary for photosynthesis was also induced, resulting in these proteins becoming the most abundant in the cotyledon proteome. Photosynthesis of the cotyledon enabled the production of light-based energy and carbohydrates, but it was less efficient than that of true leaves. Therefore, before the first true leaves have fully developed, the seedling relies on stored reserves, especially in nutrient-limiting conditions. Premature cotyledon loss triggered drastic nitrogen-saving strategies, including a reduction in protein levels, particularly those related to photosynthesis and metabolism, and a significant decrease in biomass. Once there were enough true leaves for autotrophy, the cotyledons began to senesce and the metabolism shifted to recycling and export processes (see Chapter 3: Manuscript 2). This thesis provides valuable insights into the molecular biology of protein-rich seeds. It demonstrates that the germination and seedling establishment of L. albus are characterised by the precise interplay of energy metabolism, reserve mobilisation, organ transformation, and organelle reactivation. These processes rely on the seeds stored resources.

Item Type: Thesis (PhD thesis)
Translated abstract:
Abstract
Language
Der Bedarf an ressourceneffizienten Nutzpflanzen steigt aufgrund des Klimawandels, der globalen Ressourcenknappheit und der wachsenden Nachfrage nach pflanzlichen Proteinquellen, immer weiter. In diesem Zusammenhang ist die weiße Lupine (Lupinus albus) eine besonders vielversprechende Pflanzenart. Als Leguminose mit hohem Proteingehalt gedeiht sie aufgrund ihrer besonderen Wurzelmodifikationen und der Etablierung einer Symbiose mit stickstofffixierenden Bakterien auch auf nährstoffarmen Böden. Somit stellt sie ein nachhaltiges Produktionssystem mit großem Entwicklungspotenzial dar. Um dieses Potenzial jedoch voll auszuschöpfen, ist ein detailliertes Verständnis der molekularen Mechanismen erforderlich, die die frühe Pflanzenentwicklung und Speicherstoffverwertung steuern. Während der Keimung sind Pflanzensamen heterotroph und nutzen hauptsächlich ihren eingelagerten Reserven als Nährstoffe. L. albus ist eine proteinakkumulierende Nutzpflanze, deren Samen bis zu 40 % Protein enthalten. Das Samenproteom besteht zu 85 % aus klassischen Speicherproteinen, die als Reserve für Kohlenstoff, Stickstoff und Schwefel dienen. Unsere Ergebnisse zeigen, dass diese Speichereigenschaften über die Keimung hinaus erhalten blieben. Stattdessen werden während der Keimung Lipide als Energie- und Kohlenhydratquelle genutzt. Währenddessen wurden vor allem Proteingruppen mobilisiert, die an der Trockenheitstoleranz von Samen beteiligt sind, darunter LEA-Proteine und Oleosine, die mit Speicherlipiden interagieren. Beide waren in den Samen von L. albus hochabundant und ihr Abbau setzte große Mengen der Aminosäuren Alanin, Glycin und Threonin frei. Der Katabolismus dieser Aminosäuren generierte Pyruvat und Glyoxylat. Wir vermuten, dass diese Stoffwechselintermediate, in Kombination mit Acetyl-CoA, einem Produkt der Lipid-β-Oxidation, einen Glyoxylatzyklus-Bypass bilden, der den Samen mit den für die Energieerzeugung und den Aufbau von Biomasse erforderlichen Kohlenhydraten versorgt (siehe Kapitel 2: Manuskript 1). Bei der Untersuchung von Mitochondrien aus L. albus-Samen stellten wir fest, dass diese trotz der besonderen Bedingungen im Pflanzensamen als dynamische und reaktionsbereite Organellen vorlagen und alle erforderlichen Atmungskettenkomplexe enthielten. Während der Imbibition ermöglichte die Aktivierung der Cofaktor-Biosynthese, des Transports und der Redox-Homöostase eine sofortige Energiebereitstellung. Wir identifizierten die NAD-abhängige Formiatdehydrogenase als dritthäufigstes mitochondriales Protein in Lupinensamen. Dehydrogenasen, die am mitochondrialen Aminosäurekatabolismus beteiligt sind, waren ebenfalls hochabundant vorhanden. Dies lässt vermuten, dass die Samen von L. albus über einen spezialisierten mitochondrialen Stoffwechsel verfügen. Dieser liefert Energie und Kohlenhydratvorläufer und führt gleichzeitig Entgiftungsprozesse durch. Darüber hinaus zeigte unsere Studie, dass ein erheblicher Teil des mitochondrialen Proteoms von L. albus-Samen nicht charakterisierte Proteine aufwies, für die keine Homologie zu Arabidopsis Proteinen festgestellt werden konnte. Dies deutet auf leguminosenspezifische mitochondriale Anpassungen hin (siehe Kapitel 4: Manuskript 3). Nach der Keimung zeigte L. albus epigäisches Wachstum. Die Keimblätter wurden über das Substrat angehoben, dem Licht ausgesetzt und ergrünten. Wir konnten feststellen, dass zu diesem Zeitpunkt eine Intensivierung des Speicherproteinabbaus stattfand, was zu einem Anstieg der freien Aminosäuren, insbesondere Asparagin, führte (siehe Kapitel 2: Manuskript 1). Ebenso wurde die Synthese von Proteinen, die an der Photosynthese beteiligt sind, induziert, sodass diese zur häufigsten Proteinfraktion im Keimblatt-Proteom anstiegen. Die Photosynthese der Keimblätter ermöglichte die Produktion von lichtbasierter Energie und Kohlenhydraten, war jedoch weniger effizient als die der echten Blätter. Dies lässt vermuten, dass der Keimling bis zur Etablierung der ersten echten Blätter weiterhin auf gespeicherte Reservestoffe aus den Keimblättern angewiesen ist, insbesondere unter nährstoffarmen Bedingungen. Ein vorzeitiger Verlust der Keimblätter führte zu drastischen Stickstoffeinsparstrategien. Dazu zählten eine Verringerung des Proteingehalts, hauptsächlich von Proteinen, die mit der Photosynthese und dem Proteinstoffwechsel in Verbindung stehen. Außerdem wurde die Biomasse erheblich reduziert. Sobald ausreichend echte Blätter etabliert wurden und die Pflanze somit autotroph war, begann die Seneszenz der Keimblätter und ihr Stoffwechsel verlagerte sich auf Recycling- und Exportprozesse (siehe Kapitel 3: Manuskript 2). Diese Arbeit liefert wichtige Erkenntnisse zur Molekularbiologie proteinreicher Samen. Es wird gezeigt, dass die Keimung und die frühe Entwicklung von L. albus durch das präzise Zusammenspiel von Energiestoffwechsel, Mobilisierung von Reservestoffen, Organumwandlung und Reaktivierung von Organellen gekennzeichnet sind. Dafür sind die in den Samen eingelagerten Reserven unerlässlich.
German
Creators:
Creators
Email
ORCID
ORCID Put Code
Angermann, Cecile
c.angermann@uni-koeln.de
UNSPECIFIED
URN: urn:nbn:de:hbz:38-798076
Date: 2026
Language: English
Faculty: Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Divisions: Faculty of Mathematics and Natural Sciences > Department of Biology > Botanical Institute
Subjects: Life sciences
Uncontrolled Keywords:
Keywords
Language
Protein
UNSPECIFIED
Metabolism
UNSPECIFIED
Lupinus albus
UNSPECIFIED
Legume
UNSPECIFIED
Proteomics
UNSPECIFIED
Mitochondria
UNSPECIFIED
Lupin
UNSPECIFIED
Date of oral exam: 30 January 2026
Referee:
Name
Academic Title
Hildebrandt, Tatjana M.
Prof. Dr.
Höcker, Ute
Prof. Dr.
Refereed: Yes
URI: http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/79807

Downloads

Downloads per month over past year

Export

Actions (login required)

View Item View Item