Hartlieb, Sabine A., Sieverling, Lina, Nadler-Holly, Michal, Ziehm, Matthias ORCID: 0000-0001-7074-4054, Toprak, Umut H., Herrmann, Carl ORCID: 0000-0003-4989-4722, Ishaque, Naveed ORCID: 0000-0002-8426-901X, Okonechnikov, Konstantin, Gartlgruber, Moritz, Park, Young-Gyu, Wecht, Elisa Maria, Savelyeva, Larissa, Henrich, Kai-Oliver, Rosswog, Carolina, Fischer, Matthias, Hero, Barbara, Jones, David T. W., Pfaff, Elke, Witt, Olaf, Pfister, Stefan M., Volckmann, Richard, Koster, Jan, Kiesel, Katharina, Rippe, Karsten ORCID: 0000-0001-9951-9395, Taschner-Mandl, Sabine ORCID: 0000-0002-1439-5301, Ambros, Peter, Brors, Benedikt ORCID: 0000-0001-5940-3101, Selbach, Matthias, Feuerbach, Lars and Westermann, Frank (2021). Alternative lengthening of telomeres in childhood neuroblastoma from genome to proteome. Nat. Commun., 12 (1). BERLIN: NATURE RESEARCH. ISSN 2041-1723
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Telomere maintenance by telomerase activation or alternative lengthening of telomeres (ALT) is a major determinant of poor outcome in neuroblastoma. Here, we screen for ALT in primary and relapsed neuroblastomas (n=760) and characterize its features using multi-omics profiling. ALT-positive tumors are molecularly distinct from other neuroblastoma subtypes and enriched in a population-based clinical sequencing study cohort for relapsed cases. They display reduced ATRX/DAXX complex abundance, due to either ATRX mutations (55%) or low protein expression. The heterochromatic histone mark H3K9me3 recognized by ATRX is enriched at the telomeres of ALT-positive tumors. Notably, we find a high frequency of telomeric repeat loci with a neuroblastoma ALT-specific hotspot on chr1q42.2 and loss of the adjacent chromosomal segment forming a neo-telomere. ALT-positive neuroblastomas proliferate slowly, which is reflected by a protracted clinical course of disease. Nevertheless, children with an ALT-positive neuroblastoma have dismal outcome. Alternative lengthening of telomeres (ALT) is associated with a poor outcome in neuroblastoma. Here, the authors find that ALT is associated with mutated ATRX and/or reduced protein abundance, frequent telomeric repeat loci and heterochromatic telomeric chromatin.
Item Type: | Journal Article | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creators: |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:38-601581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DOI: | 10.1038/s41467-021-21247-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Journal or Publication Title: | Nat. Commun. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Volume: | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number: | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Date: | 2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publisher: | NATURE RESEARCH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Place of Publication: | BERLIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ISSN: | 2041-1723 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Language: | English | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Faculty: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Divisions: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subjects: | no entry | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uncontrolled Keywords: |
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URI: | http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/60158 |
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