Jurmeister, Philipp, Vollbrecht, Claudia ORCID: 0000-0002-0861-001X, Joehrens, Korinna, Aust, Daniela, Behnke, Anke, Stenzinger, Albrecht, Penzel, Roland, Endris, Volker, Schirmacher, Peter, Fisseler-Eckhoff, Annette, Neumann, Jens, Kirchner, Thomas, Buettner, Reinhard, Merkelbach-Bruse, Sabine, Kreipe, Hans, Jonigk, Danny, Jochum, Wolfram, Rodriguez, Regulo, Dietel, Manfred, Horst, David, Hummel, Michael
ORCID: 0000-0001-6717-605X and von Laffert, Maximilian
(2021).
Status quo of ALK testing in lung cancer: results of an EQA scheme based on in-situ hybridization, immunohistochemistry, and RNA/DNA sequencing.
Virchows Arch., 479 (2).
S. 247 - 256.
NEW YORK:
SPRINGER.
ISSN 1432-2307
Abstract
With this external quality assessment (EQA) scheme, we aim to investigate the diagnostic performance of the currently available methods for the detection of ALK alterations in non-small cell lung cancer on a national scale, namely, in situ hybridization (ISH), immunohistochemistry (IHC), and RNA/DNA sequencing (NGS). The EQA scheme cohort consisted of ten specimens, including four ALK positive and six ALK negative samples, which were thoroughly pretested using IHC, ISH, and RNA/DNA NGS. Unstained tumor sections were provided to the 57 participants, and the results were retrieved via an online questionnaire. ISH was used by 29, IHC by 38, and RNA/DNA sequencing by 19 participants. Twenty-eight institutions (97%) passed the ring trial using ISH, 33 (87%) by using IHC, and 18 (95%) by using NGS. The highest sensitivity and interrater agreement (Fleiss ' kappa) was observed for RNA/DNA sequencing (99%, 0.975), followed by ISH (94%, 0.898) and IHC (92%, 0.888). However, the proportion of samples that were not evaluable due to bad tissue quality was also higher for RNA/DNA sequencing (4%) compared with ISH (0.7%) and IHC (0.5%). While all three methods produced reliable results between the different institutions, the highest sensitivity and concordance were observed for RNA/DNA sequencing. These findings encourage the broad implementation of this method in routine diagnostic, although the application might be limited by technical capacity, economical restrictions, and tissue quality of formalin-fixed samples.
Item Type: | Journal Article | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creators: |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
URN: | urn:nbn:de:hbz:38-602242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DOI: | 10.1007/s00428-021-03106-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Journal or Publication Title: | Virchows Arch. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Volume: | 479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number: | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Page Range: | S. 247 - 256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Date: | 2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publisher: | SPRINGER | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Place of Publication: | NEW YORK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ISSN: | 1432-2307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Language: | English | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Faculty: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Divisions: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subjects: | no entry | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uncontrolled Keywords: |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
URI: | http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/60224 |
Downloads
Downloads per month over past year
Altmetric
Export
Actions (login required)
![]() |
View Item |