Goulart Salgueiro, Willian ORCID: 0000-0002-5283-634X (2026). Sulfide Metabolism Controls Physiological Adaptation in vhl-1 Mutants and Underlies Mesna-Mediated Cytoprotection via sqrd-1/Sqor in C. elegans and Renal Cells. PhD thesis, Universität zu Köln.

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Abstract

Hydrogen sulfide (H₂S) has emerged as a critical gaseous mediator at the intersection of hypoxia signaling, redox balance, and mitochondrial function. However, the mechanisms by which H₂S metabolism influences hypoxia-inducible factor (HIF-1) activity, organismal resilience, and lifespan remain incompletely understood. This thesis addresses three central questions: (i) which and how sulfide-metabolizing enzymes mediate the phenotypic consequences of HIF-1 activation in Caenorhabditis elegans, (ii) how H₂S and persulfide metabolism interact with the hypoxia pathway to shape stress resistance and longevity, and (iii) whether Mesna, an FDA-approved thiol drug, can be repurposed as a modulator of sulfide/persulfide metabolism with protective effects in ischemia–reperfusion injury. By combining genetics, proteomics, and functional assays in C. elegans and kidney cells, I dissect the contribution of specific enzymes—mainly sqrd-1/Sqor—to hypoxia adaptation, mitochondrial remodeling, and drug responsiveness. Genetic analysis identified sqrd-1(mr28), (sulfide:quinone oxidoreductase), as a determinant of lifespan and body size in vhl-1(ok161) mutants, linking sulfide detoxification to HIF-1-driven adaptations. Proteomics and functional assays revealed that sqrd-1 loss reprograms mitochondrial pathways, suggesting that sulfide flux directly modulates oxidative phosphorylation. Collagen hydroxylases and glutathione S-transferases further emerged as lifespan regulators in the vhl-1 background, highlighting cross-talk between extracellular matrix remodeling, detoxification, and hypoxia signaling. Most importantly, we identified subunits of the mitochondrial complex I seem to mediate the long lifespan of vhl-1(ok161) mutants in a sqrd-1 dependent manner. Mesna preconditioning protected C. elegans against hypoxia, protein aggregation, paraquat-induced oxidative stress and shortened lifespan, with effects partly dependent on sulfide metabolism. Mechanistically, Mesna improved the redox state by shifting the glutathione pool toward a reduced state, promoted persulfide accumulation, and altered mitochondrial proteome signatures. In sqrd-1(mr28) knockout mutants, Mesna conferred even greater protection, while mpst-1(ok2040) mutation ablated the protective effect, underscoring enzyme-specific modulation. In mIMCD3 cells, Mesna preconditioning prevented paraquat-induced cell death, reduced mitochondrial ROS and lipid peroxidation, and improved ATP maintenance in a SQOR dependent manner. These findings point to Mesna as a novel modulator of sulfide/persulfide metabolism with translational relevance for renal IRI. Overall, this work implicates sulfide metabolism as a key player in hypoxia adaptation, lifespan, and mitochondrial resilience, and positions Mesna as a clinically relevant candidate for repurposing in kidney protection strategies.

Item Type: Thesis (PhD thesis)
Translated title:
Title
Language
Der Sulfidstoffwechsel steuert die physiologische Anpassung bei vhl-1-Mutanten und bildet die Grundlage für die durch Mesna vermittelte Zytoprotektion über sqrd-1/Sqor in C. elegans und Nierenzellen
German
Translated abstract:
Abstract
Language
Wasserstoffsulfid (H₂S) hat sich als ein zentraler gasförmiger Mediator an der Schnittstelle von Hypoxiesignalwegen, Redox-Homöostase und mitochondrialer Funktion etabliert. Die Mechanismen, durch die der H₂S-Stoffwechsel die Aktivität des hypoxieinduzierbaren Faktors (HIF-1), die organismische Widerstandsfähigkeit und die Lebensspanne beeinflusst, sind jedoch noch nicht vollständig verstanden. Diese Arbeit untersucht drei zentrale Fragestellungen: (i) welche sulfidmetabolisierenden Enzyme die phänotypischen Konsequenzen einer HIF-1-Aktivierung in Caenorhabditis elegans vermitteln und auf welche Weise dies geschieht, (ii) wie H₂S- und Persulfidstoffwechsel mit dem Hypoxiesignalweg interagieren, um Stressresistenz und Langlebigkeit zu beeinflussen, und (iii) ob Mesna, ein von der FDA zugelassenes Thiol-Medikament, als Modulator des Sulfid-/Persulfidstoffwechsels mit protektiven Effekten bei Ischämie-Reperfusions-Schäden neu eingesetzt werden kann. Durch die Kombination von Genetik, Proteomik und funktionellen Analysen in C. elegans und Nierenzellen untersuche ich den Beitrag spezifischer Enzyme – insbesondere sqrd-1/Sqor – zur Hypoxieanpassung, mitochondrialen Umgestaltung und Arzneimittelantwort. Die genetische Analyse identifizierte sqrd-1(mr28) (Sulfid:Chinon-Oxidoreduktase) als einen Determinanten von Lebensspanne und Körpergröße in vhl-1(ok161)-Mutanten und stellte damit eine Verbindung zwischen Sulfidentgiftung und HIF-1-vermittelten Anpassungen her. Proteomische und funktionelle Analysen zeigten, dass der Verlust von sqrd-1 mitochondriale Signalwege umprogrammiert, was darauf hindeutet, dass der Sulfidfluss die oxidative Phosphorylierung direkt moduliert. Kollagenhydroxylasen und Glutathion-S-Transferasen erwiesen sich zudem als Regulatoren der Lebensspanne im vhl-1-Hintergrund und verdeutlichten die Wechselwirkung zwischen Remodeling der extrazellulären Matrix, Entgiftung und Hypoxiesignalwegen. Besonders wichtig war die Identifikation von Untereinheiten des mitochondrialen Komplexes I, die die verlängerte Lebensspanne von vhl-1(ok161)-Mutanten in einer sqrd-1-abhängigen Weise zu vermitteln scheinen. Eine Vorbehandlung mit Mesna schützte C. elegans vor Hypoxie, Proteinaggregation, Paraquat-induziertem oxidativem Stress sowie einer verkürzten Lebensspanne, wobei diese Effekte teilweise vom Sulfidstoffwechsel abhängig waren. Mechanistisch verbesserte Mesna den Redoxzustand, indem es den Glutathionpool in Richtung eines reduzierten Zustands verschob, die Akkumulation von Persulfiden förderte und mitochondriale Proteomsignaturen veränderte. In sqrd-1(mr28)-Knockout-Mutanten vermittelte Mesna sogar einen stärkeren Schutz, während die mpst-1(ok2040)-Mutation den protektiven Effekt vollständig aufhob, was auf eine enzymspezifische Modulation hinweist. In mIMCD3-Zellen verhinderte eine Mesna-Vorbehandlung den durch Paraquat induzierten Zelltod, reduzierte mitochondriale ROS und Lipidperoxidation und verbesserte die ATP-Aufrechterhaltung in einer SQOR-abhängigen Weise. Diese Ergebnisse weisen auf Mesna als einen neuartigen Modulator des Sulfid-/Persulfidstoffwechsels mit translationaler Relevanz für renale Ischämie-Reperfusions-Schäden hin. Insgesamt zeigt diese Arbeit, dass der Sulfidstoffwechsel ein zentraler Faktor für Hypoxieanpassung, Lebensspanne und mitochondriale Widerstandsfähigkeit ist, und positioniert Mesna als einen klinisch relevanten Kandidaten für die Wiederverwendung in Strategien zum Nierenschutz.
German
Creators:
Creators
Email
ORCID
ORCID Put Code
Goulart Salgueiro, Willian
willian_cgs@hotmail.com
UNSPECIFIED
URN: urn:nbn:de:hbz:38-803180
Date: 2026
Language: English
Faculty: Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Divisions: CECAD - Cluster of Excellence Cellular Stress Responses in Aging-Associated Diseases
Subjects: Natural sciences and mathematics
Life sciences
Medical sciences Medicine
Uncontrolled Keywords:
Keywords
Language
Hydrogen sulfide
UNSPECIFIED
sqrd-1
UNSPECIFIED
vhl-1
UNSPECIFIED
Mesna
UNSPECIFIED
C. elegans
UNSPECIFIED
hypoxia
UNSPECIFIED
cytoprotection
UNSPECIFIED
mIMCD3
UNSPECIFIED
persulfidation
UNSPECIFIED
Date of oral exam: 5 December 2025
Referee:
Name
Academic Title
Müller, Roman-Ulrich
Dr
Schwarz, Günter
Dr.
Schumacher, Björn
Dr.
Refereed: Yes
URI: http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/80318

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