Elsner, Anna-Lena ORCID: 0009-0000-3231-2007 (2026). Novel covalent FAP inhibitors: preparation and validation of target binding by 18F release. PhD thesis, Universität zu Köln.

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Abstract

Endoradiotherapy is a systemic treatment approach to selectively deliver a cytotoxic dose of radiation to tumors or other abnormal tissue. For this purpose, compounds labeled with therapeutic radionuclides (usually α- or β–-emitters with a suitable half-life) are used, which are capable of selectively interfere with macromolecules, structures, or biological processes in the target tissue. Fibroblast activation protein (FAP) is a membrane-anchored protein that is overexpressed in the microenvironment of most malignant solid tumors but absent in benign tumors or healthy tissue, making it a promising target for endoradiotherapy. Numerous radiolabeled FAP inhibitors (FAPIs) are widely applied for diagnostic imaging. However, the application of existing FAPIs labeled with therapeutic radionuclides is limited by their insufficient tumor retention. A primary objective of this study was therefore to improve tumor retention through the development of FAPIs capable of forming an irreversible covalent bond with the enzyme's active site. The novel compounds were designed based on the core structure of the most popular FAPI, UAMC-1110, with the nitrile moiety replaced by a covalently binding 18F-substituted warhead. Release of [18F]fluoride upon covalent interaction of the inhibitors with the active site of FAP was intended to provide indirect evidence of covalent bond formation. Three FAPIs with an 18F-labeled warhead were synthesized and their stability was assessed in aqueous media across various pH values and under physiological conditions in phosphate-buffered saline (PBS) and human blood plasma. An inhibitor bearing a sulfonyl [18F]fluoride warhead could be labeled with radiochemical conversions (RCCs) of 58 ± 12% using SuFEx-based ultra-fast 18F/19F isotopic exchange and isolated in radiochemical yields (RCYs) of 24 ± 3%. However, due to its insufficient stability, this inhibitor was not further pursued. Following the synthesis and successful radiofluorination of model phosphonate compounds, a FAPI with an 18F-labeled phosphonofluoridate warhead was prepared in RCYs of 56 ± 9%. This compound proved to be stable for at least 2 h in aqueous media (pH 2−10) and in human blood plasma, with no evidence of defluorination. In enzyme assays with FAP, [18F]fluoride release was observed, whereas no release occurred in the presence of the FAP-related peptidases DPP 2, DPP 4 and DPP 9, indicating selectivity for FAP. However, even greater [18F]fluoride release was observed in the presence of PREP, suggesting higher affinity for this enzyme. A third FAPI was developed by replacement of the nitrile group with an 18F-labeled phosphonofluoridodithoate warhead. A model radiofluorinated phosphonofluoridodithoate was first prepared and its in vitro stability was subsequently investigated. These experiments confirmed the high stability of the labeled compounds. Afterwards, the 18F-labeled FAPI was produced from the respective oxydithiaphospholan-2-sulfide precursor in RCYs of 46 ± 11%. The candidate demonstrated sufficient stability over a period of 2 h under physiological conditions. However, no coupling to FAP was detected, as demonstrated by the absence of [18F]fluoride release in all enzymatic assays. In summary, three potential FAPIs with novel 18F-labeled warheads instead of the conventional cyano group were prepared, whereby the candidate with a phosphonofluoridate moiety demonstrated sufficient stability and covalent binding to FAP in in vitro experiments. This compound could serve as a lead candidate for the development of FAP-specific radiotherapeutics exhibiting prolonged retention in tumor tissue.

Item Type: Thesis (PhD thesis)
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Abstract
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Die Endoradiotherapie ist ein systemischer Therapieansatz, bei dem eine zytotoxische Strahlendosis selektiv an Tumorgewebe abgegeben wird. Dazu werden Verbindungen eingesetzt, die mit therapeutischen Radionukliden (in der Regel α- or β–-Strahler mit einer geeigneten Halbwertszeit) markiert sind und selektiv mit Molekülen, Strukturen oder Stoffwechselprozessen des Targetgewebes wechselwirken. Das Fibroblasten-Aktivierungsprotein (FAP) ist ein membrangebundenes Protein, das im Tumormikromilieu der meisten bösartigen soliden Tumoren überexprimiert wird, jedoch in gutartigen Tumoren oder gesundem Gewebe nicht nachweisbar ist. Damit stellt es ein vielversprechendes Ziel für die Endoradiotherapie dar. Zahlreiche radioaktiv markierte FAP-Inhibitoren (FAPIs) werden bereits für die diagnostische Bildgebung eingesetzt. Die Anwendung bestehender, mit therapeutischen Radionukliden markierter FAPIs ist jedoch aufgrund ihrer unzureichenden Tumorretention begrenzt. Ein zentrales Ziel dieser Arbeit war daher die Verbesserung der Tumorretention durch die Entwicklung von FAPIs, die eine irreversible kovalente Bindung mit dem aktiven Zentrum des Enzyms eingehen können. Die neuartigen Verbindungen wurden auf der Basis der Struktur des meistgenutzten FAPIs, UAMC-1110, entwickelt, wobei die Nitril-Gruppe durch eine kovalent bindende 18Fluor-substituierte Wirkkomponente ersetzt wurde. Die Freisetzung von [18F]Fluorid bei kovalenter Wechselwirkung der Inhibitoren mit dem aktiven Zentrum des FAP-Enzyms sollte einen indirekten Nachweis für die Bildung einer kovalenten Bindung liefern. Drei FAPIs mit einer 18F-markierten Wirkkomponente wurden synthetisiert und ihre Stabilität in wässrigen Medien bei verschiedenen pH-Werten sowie unter physiologischen Bedingungen in phosphatgepufferter Kochsalzlösung (PBS) und humanem Blutplasma untersucht. Ein Inhibitor mit einem Sulfonyl[18F]fluorid-Warhead konnte mittels SuFEx-basiertem ultraschnellem 18F/19F Isotopenaustausch mit radiochemischen Umsätzen (RCUs) von 58 ± 12% markiert und in radiochemischen Ausbeuten (RCAs) von 24 ± 3% isoliert werden. Aufgrund seiner unzureichenden Stabilität wurde dieser Inhibitor jedoch nicht weiterverfolgt. Nach der Synthese und erfolgreichen Radiofluorierung von Modell-Phosphonatverbindungen wurde ein FAPI mit einem 18F-markierten Phosphonofluoridate-Warhead in RCAs von 56 ± 9% hergestellt. Diese Verbindung war in wässrigen Medien (pH 2–10) und in humanem Blutplasma für mindestens zwei Stunden stabil, ohne dass Anzeichen für eine Defluorierung beobachtet wurden. In Enzymassays mit FAP wurde eine Freisetzung von [18F]Fluorid beobachtet, während in Gegenwart der FAP-verwandten Peptidasen DPP 2, DPP 4 und DPP 9 keine Freisetzung auftrat, was auf eine Selektivität für FAP hinweist. In Gegenwart von PREP wurde jedoch eine höhere Freisetzung von [18F]Fluorid beobachtet, was auf eine größere Affinität für dieses Enzym hinweist. Ein dritter FAPI wurde durch Substitution der Nitrilgruppe mit einem 18F-markierten Phosphonofluoridodithoat-Warhead entwickelt. Zunächst wurde eine radiofluorierte Phosphonofluoridodithoat-Modellverbindung hergestellt und deren In-vitro-Stabilität untersucht. Die markierten Verbindungen zeigten in diesen Experimenten eine hohe Stabilität. Anschließend wurde das 18F-markierte FAPI aus dem entsprechenden Oxydithiaphospholan-2-sulfid-Vorläufer in RCAs von 46 ± 11% hergestellt. Der Kandidat zeigte über einen Zeitraum von zwei Stunden unter physiologischen Bedingungen eine ausreichende Stabilität. Es wurde jedoch keine Bindung an FAP festgestellt, was durch die fehlende [18F]Fluorid-Freisetzung in Enzymassays belegt wurde. Insgesamt wurden drei potenzielle FAPI mit den neuen 18F-markierten Wirkkomponenten anstelle der konventionellen Cyano-Gruppe hergestellt, wobei die Phosphonofluoridate-Verbindung eine ausreichende Stabilität und in In-vitro-Experimeten eine kovalente Bindung zu FAP zeigte. Diese Verbindung kann als Leitmotiv für die Entwicklung von FAP-spezifischen Radiotherapeutika mit einer längeren Tumorretention dienen.
German
Creators:
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Email
ORCID
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Elsner, Anna-Lena
anna-lena.elsner@web.de
UNSPECIFIED
URN: urn:nbn:de:hbz:38-803234
Date: 2026
Language: English
Faculty: Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Divisions: Faculty of Medicine > Weitere > Institut für Radiochemie und Experimentelle Molekulare Bildgebung
Subjects: Chemistry and allied sciences
Uncontrolled Keywords:
Keywords
Language
Radiotracer
UNSPECIFIED
Nuklearchemie
UNSPECIFIED
Date of oral exam: 27 March 2026
Referee:
Name
Academic Title
Neumaier, Bernd
Professor Doktor
Klein, Axel
Professor Doktor
Refereed: Yes
URI: http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/80323

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