Breuer, Helen (2026). The role of AIS proteins ANKG and TRIM46 in TAU sorting and microtubule organization in human neuronal models. PhD thesis, Universität zu Köln.

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Abstract

The neuronal protein TAU regulates microtubule (MT) stability and polymerization. Under physiological conditions, TAU is predominantly localized to the axon, but under pathological circumstances it can mislocalize to the somatodendritic compartment. This mislocalization represents an early step within the pathophysiological cascade of tauopathies, including Alzheimer’s disease (AD) and frontotemporal dementia (FTD). Mislocalized TAU leads to MT destabilization, impaired axonal transport, synaptic toxicity, and ultimately neurodegeneration. To counteract TAU missorting, it is essential to understand the physiological mechanisms that enable its enrichment in the axon. The axon initial segment (AIS) is a specialized structural domain in the proximal axon that plays a key role in maintaining neuronal polarity – that is, the structural and functional separation of the axonal and dendritic compartment. In addition, AIS alterations were observed in AD mouse models and human postmortem brain tissue from AD patients. The AIS has therefore been proposed as a potential regulator of axonal TAU sorting. In addition, the neuronal MT network is of central importance for TAU polarity, as it is also involved in several mechanisms of TAU sorting and is itself directly affected by TAU missorting. So far, neuronal polarization (including AIS formation, MT organization and TAU distribution) as well as physiological and pathological TAU functions have mainly been studied in primary rodent neurons and tauopathy mouse models. However, due to limitations of these models many of the described mechanisms cannot be transferred to the human central nervous system (CNS), contributing to the limited therapeutic progress in tauopathies. The aim of this study was therefore to establish a human neuronal model that reliably recapitulates TAU sorting, AIS formation and MT organization, and to use this model to resolve the contribution of the AIS to axonal TAU sorting. Our experiments focused on two key AIS proteins: (a) Ankyrin G (ANKG), the master organizer of the AIS, and (b) TRIM46, an AIS-specific MT-organizing protein. For this, we used human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived neurons and neurons derived from the human SH-SY5Y neuroblastoma cell line in comparison to primary mouse forebrain neurons, a well-established AIS and TAU sorting model. We discovered that iPSC-derived neurons develop a typical AIS within the first ~40 μm of the axon, marked by the synchronized accumulation and colocalization of TRIM46 and ANKG. The gradual integration of both proteins in the proximal axon required a considerable time of ~1.5 weeks and correlated with progressive axonal TAU enrichment and structural polarization. The AIS structure, cellular polarization and extent of TAU sorting in iPSC-derived neurons were comparable to those of primary mouse neurons. In contrast, we found that SH-SY5Y-derived neurons lacked ANKG and thereby a classical AIS, but expressed TRIM46 upon neuronal differentiation. However, TRIM46 was less enriched at the proximal axon than in iPSC-derived neurons and primary mouse neurons. Despite AIS-deficiency, SH-SY5Y-derived neurons attained axonal outgrowth and polarized TAU sorting, with a slightly lower efficiency than iPSC- and primary mouse neurons. We analyzed MT organization of SH-SY5Y- and iPSC-derived neurons in the proximal axon, distal axon and dendrite using EB3 live-cell imaging. Both neuron types showed a polarized MT structure characteristic of differentiated neurons, with unidirectional (~95% plus-end out) MTs in axons and mixed MT polarity (~75% plus-end out) in dendrites. SH-SY5Y-derived neurons exhibited more dynamic MTs than iPSC-derived neurons, while MT polymerization speeds were similar in both human neuron types and exceeded reported velocities in rodent and non-mammalian neurons. In conclusion, our findings indicate that MT polarization and axonal TAU sorting do not primarily depend on ANKG, as these processes were also observed in SH-SY5Y neurons. Instead, we propose that TRIM46 is responsible for anterograde MT orientation in axons, which may enable axonal TAU enrichment by means of active transport, while ANKG maintains neuronal polarity and excitability in mature neurons without directly influencing axosomatic TAU distribution. While we found SH-SY5Y-derived neurons as a practical and proliferative model for the basic study of human MT dynamics and TAU sorting, iPSC-derived neurons represent a more mature model applicable for more profound TAU studies involving aspects such as the AIS, synapses and TAU-isoform-specific functions. In summary, this study (a) established quantitative measures of AIS assembly, MT dynamics and TAU (mis)sorting in two human neuronal models, (b) developed a protocol for live-cell imaging of MT polymerization in human neurons, (c) showed that MT polarization and basal axodendritic TAU polarity can be established independently from ANKG, and (d) characterized iPSC-derived neurons as a well-suited model for the study of neuronal polarization and TAU (mis)sorting that offers many future applications in tauopathy research.

Item Type: Thesis (PhD thesis)
Translated title:
Title
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Die Rolle der AIS-Proteine ANKG und TRIM46 bei der TAU-Sortierung und Mikrotubuli-Organisation in humanen neuronalen Zellmodellen
German
Translated abstract:
Abstract
Language
Das Protein TAU ist ein neuronales Protein, das die Stabilität und Polymerisierung von Mikrotubuli (MT) reguliert. TAU ist normalerweise überwiegend im Axon lokalisiert, kann jedoch unter pathologischen Bedingungen in das somatodendritische Kompartiment fehlsortiert werden. Diese Fehlverlagerung stellt einen frühen Schritt in der pathophysiologischen Kaskade von Tauopathien dar, zu denen unter anderem die Alzheimer-Krankheit (AD) und die frontotemporale Demenz (FTD) zählen. Fehlverteiltes TAU führt im weiteren Verlauf zu einer Destabilisierung von Mikrotubuli, Störungen des axonalen Transports, synaptischer Toxizität und letztlich zu Neurodegeneration. Um TAU-Fehlsortierung gezielt entgegenzuwirken, müssen die physiologischen Sortierungsmechanismen verstanden werden, die eine Anreicherung von TAU im Axon ermöglichen. Das Axon-Initialsegment (AIS) ist eine spezialisierte Struktureinheit im proximalen Axon, die eine Schlüsselrolle bei der Aufrechterhaltung der neuronalen Polarität – also der Trennung des axonalen und dendritischen Kompartiments – einnimmt. Daher wurde das AIS als möglicher Regulator der axonalen TAU-Sortierung vorgeschlagen. Darüber hinaus ist die Untersuchung des neuronalen MT-Netzwerks von zentraler Bedeutung, da es zum einen ebenfalls an verschiedenen Mechanismen der TAU-Sortierung beteiligt ist und zum anderen selbst direkt von TAU-Fehlsortierung betroffen ist. Bislang wurden sowohl neuronale Polarisierung (inklusive AIS-Etablierung, MT-Struktur und TAU-Verteilung) als auch physiologische und pathologische TAU-Funktionen hauptsächlich in primären Nagetierneuronen und Tauopathie-Mausmodellen untersucht. Aufgrund verschiedener Einschränkungen dieser Modelle (insb. unterschiedliche TAU-Isoformen und Sequenzen, Überexpressionsartefakte, fehlende endogene Tau-Pathologie) lassen sich viele der beschriebenen Mechanismen jedoch nicht auf das menschliche zentrale Nervensystem (ZNS) übertragen, was sich auch in den bislang geringen therapeutischen Erfolgen im Bereich der Tauopathien widerspiegelt. Das Ziel der vorliegenden Arbeit bestand daher in der Etablierung eines humanen Zellmodells, das eine zuverlässige Modellierung der TAU-Sortierung, AIS-Bildung und MT-Organisierung erlaubt und sich sowohl für die Untersuchung physiologischer als auch pathologischer TAU-Funktionen eignet. Zudem untersuchten wir den Beitrag des AIS zur axonalen TAU-Sortierung mit besonderem Fokus auf zwei zentralen AIS-Proteinen: (a) Ankyrin G (ANKG), dem Hauptorganisator des AIS, und (b) TRIM46, einem AIS-spezifischen Protein der Mikrotubuli-Organisation. Dazu setzten wir aus humanen induzierten pluripotenten Stammzellen (iPSC) abgeleitete Neuronen sowie neuronal differenzierte humane SH-SY5Y-Neuroblastomzellen ein und verglichen sie mit primären Mausvorderhirnneuronen, die ein etabliertes Modell für neuronale Polarisierung und AIS-Studien darstellen. Unsere Analysen mittels Immunfluoreszenz und qPCR zeigen, dass iPSC-abgeleitete Neuronen innerhalb der ersten ~40 μm des Axons ein typisches AIS ausbilden, gekennzeichnet durch die synchrone Akkumulation und Kolokalisation von ANKG und TRIM46. Die vollständige Integration dieser Proteine in das proximale Axon benötigte rund 1,5 Wochen und korrelierte mit der fortschreitenden Anreicherung axonalen TAUs sowie der strukturellen Polarisierung der iPSC-Neuronen. Die AIS-Struktur, neuronale Polarisierung und TAU-Sortierung waren mit denen primärer Mausneuronen vergleichbar. Im Gegensatz dazu fehlte SH-SY5Y-Neuronen ANKG und damit ein klassisches AIS. Zwar exprimierten sie nach neuronaler Differenzierung TRIM46, jedoch in geringerem Maße als iPSC- und Mausneuronen. Dennoch erreichten auch AIS-defiziente SH-SY5Y-Neuronen zelluläre Polarität und eine axonale TAU-Verteilung, wenn auch mit reduzierter Effizienz. Darüber hinaus etablierten wir ein Protokoll zur Visualisierung von Mikrotubuli-Polymerisierung in iPSC- und SH-SY5Y-Neuronen mittels EB3-Live-Cell-Imaging. Dadurch konnten wir das MT-Netzwerk von iPSC- und SH-SY5Y-Neuronen im proximalen und distalen Axon sowie in den Dendriten analysieren. Beide Zelltypen zeigten die für differenzierte Neuronen typische MT-Polarisierung: unidirektionale MTs im Axon (~95 % Plus-Ende der MTs nach außen) und gemischte Polarität in Dendriten (~75 % Plus-Ende der MTs nach außen). SH-SY5Y-Zellen wiesen dynamischere MTs auf, während die Polymerisationsgeschwindigkeit in beiden humanen Zelltypen ähnlich war und deutlich höher lag als in verschiedenen Tiermodellen aus früheren Studien. Um die funktionelle Rolle von ANKG und TRIM46 weiter zu prüfen, wurden ergänzend shRNA-Knockdown-Experimente in iPSC-Neuronen mittels liposomaler Transfektion und lentiviraler Transduktion durchgeführt. Zwar ließ sich die lentivirale Transduktion insgesamt als effiziente Methode zur Expression von shRNA und Reportergenen in iPSC-Neuronen etablieren, ein spezifischer Knockdown der AIS-Proteine wurde jedoch nicht erreicht, was vermutlich auf methodische Limitationen im shRNA-Design, die Langlebigkeit der AIS-Proteine oder mögliche Off-Target-Effekte zurückzuführen ist. Insgesamt deuten unsere Ergebnisse jedoch darauf hin, dass die MT-Polarisierung und die axonale TAU-Sortierung nicht primär von ANKG abhängen, da diese Prozesse regelhaft in SH-SY5Y-Neuronen stattfanden. Stattdessen scheint TRIM46, wie in vorherigen Studien gezeigt, die anterograde MT-Ausrichtung im Axon zu steuern und könnte damit die Anreicherung von TAU durch aktiven Transport ermöglichen. ANKG hingegen trägt offenbar in reifen Neuronen eher zur Aufrechterhaltung der Polarität und neuronalen Erregbarkeit bei, ohne die axonale TAU-Anreicherung direkt zu beeinflussen. Während SH-SY5Y-Zellen ein praktikables und leicht zu vermehrendes Modell für grundlegende Studien zu MT-Dynamik und TAU-Sortierung darstellen, bieten iPSC-abgeleitete Neuronen bessere Voraussetzungen für vertiefte TAU-Studien, die etwa das AIS, synaptische Interaktionen oder isoformspezifische TAU-Funktionen einbeziehen. Zusammenfassend wurden in dieser Arbeit (a) quantitative Parameter zu AIS-Aufbau, MT-Dynamik und TAU-Sortierung in zwei humanen Zellmodellen etabliert, (b) ein Protokoll zur Visualisierung der Mikrotubuli-Polymerisierung in lebenden menschlichen Neuronen mittels EB3-Live-Cell-Imaging entwickelt, (c) gezeigt, dass MT-Polarisierung und basale axodendritische TAU-Polarität unabhängig von ANKG möglich sind, und (d) iPSC-Neuronen als geeignetes Modell für die Erforschung neuronaler Polarisierung und TAU-(Fehl)sortierung hervorgehoben, welches vielfältige Anwendungen in der Tauopathieforschung ermöglicht.
German
Creators:
Creators
Email
ORCID
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Breuer, Helen
helenbreuer8@gmail.com
UNSPECIFIED
UNSPECIFIED
URN: urn:nbn:de:hbz:38-811343
Date: 2026
Language: English
Faculty: Faculty of Medicine
Divisions: Faculty of Medicine > Humangenetik > Institut für Humangenetik
Subjects: Medical sciences Medicine
Uncontrolled Keywords:
Keywords
Language
tau
English
Axon initial segment
English
microtubules
English
neuronal polarity
English
iPSC
English
tauopathies
English
alzheimer
English
eb3
English
TRIM46
English
ankyrin G
English
UNSPECIFIED
English
Date of oral exam: 8 May 2026
Referee:
Name
Academic Title
Wirth, Brunhilde
Dr. rer. nat.
van Eimeren, Thilo
Dr. med.
Refereed: Yes
URI: http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/81134

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