Renner, Sina, Schueler, Helke, Alawi, Malik, Kolbe, Verena, Rybczynski, Meike, Woitschach, Rixa, Sheikhzadeh, Sara, Stark, Veronika C., Olfe, Jakob, Roser, Elke, Seggewies, Friederike Sophia, Mahlmann, Adrian, Hempel, Maja, Hartmann, Melanie J., Hillebrand, Mathias, Wieczorek, Dagmar, Volk, Alexander Erich, Kloth, Katja, Koch-Hogrebe, Margarete, Abou Jamra, Rami, Mitter, Diana, Altmueller, Janine, Wey-Fabrizius, Alexandra, Petersen, Christine, Rau, Isabella, Borck, Guntram, Kubisch, Christian, Mir, Thomas S., von Kodolitsch, Yskert, Kutsche, Kerstin and Rosenberger, Georg (2019). Next-generation sequencing of 32 genes associated with hereditary aortopathies and related disorders of connective tissue in a cohort of 199 patients. Genet. Med., 21 (8). S. 1832 - 1842. NEW YORK: NATURE PUBLISHING GROUP. ISSN 1530-0366
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Purpose: Heritable factors play an important etiologic role in connective tissue disorders (CTD) with vascular involvement, and a genetic diagnosis is getting increasingly important for gene-tailored, personalized patient management. Methods: We analyzed 32 disease-associated genes by using targeted next-generation sequencing and exome sequencing in a clinically relevant cohort of 199 individuals. We classified and refined sequence variants according to their likelihood for pathogenicity. Results: We identified 1 pathogenic variant (PV; in FBN1 or SMAD3) in 15 patients (7.5%) and >= 1 likely pathogenic variant (LPV; in COL3A1, FBN1, FBN2, LOX, MYH11, SMAD3, TGFBR1, or TGFBR2) in 19 individuals (9.6%), together resulting in 17.1% diagnostic yield. Thirteen PV/LPV were novel. Of PV/LPV-negative patients 47 (23.6%) showed >= 1 variant of uncertain significance (VUS). Twenty-five patients had concomitant variants. In-depth evaluation of reported/calculated variant classes resulted in reclassification of 19.8% of variants. Conclusion: Variant classification and refinement are essential for shaping mutational spectra of disease genes, thereby improving clinical sensitivity. Obligate stringent multigene analysis is a powerful tool for identifying genetic causes of clinically related CTDs. Nonetheless, the relatively high rate of PV/LPV/VUS-negative patients underscores the existence of yet unknown disease loci and/or oligogenic/polygenic inheritance.
Item Type: | Journal Article | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creators: |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:38-145968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DOI: | 10.1038/s41436-019-0435-z | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Journal or Publication Title: | Genet. Med. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Volume: | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number: | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Page Range: | S. 1832 - 1842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Date: | 2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publisher: | NATURE PUBLISHING GROUP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Place of Publication: | NEW YORK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ISSN: | 1530-0366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Language: | English | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Faculty: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Divisions: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subjects: | no entry | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uncontrolled Keywords: |
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Refereed: | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
URI: | http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/14596 |
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