Pan, Jiyoung
ORCID: 0009-0003-7443-5621
(2026).
ATM-dependent RHEB phosphorylation couples DNA damage to lysosomal mTORC1 signaling to orchestrate the cellular response to genotoxic stress.
PhD thesis, Universität zu Köln.
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Abstract
Cells dynamically adapt to environmental stressors by rewiring signaling networks that coordinate growth, metabolism, and genome maintenance. The DNA damage response (DDR) and mTORC1 signaling pathways govern DNA repair and cell growth, respectively, but how these pathways intersect remains incompletely understood. Here, we identify RHEB, the most direct mTORC1 activator, as a substrate of the DDR kinase ATM. Strikingly, we find that, although genotoxic stress differentially regulates mTORC1 activity—reducing the phosphorylation of its lysosomal target TFEB, while enhancing phosphorylation of its cytoplasmic target S6K—the DDR-induced phosphorylation of RHEB specifically controls the lysosomal mTORC1 signaling branch. Preventing RHEB phosphorylation impairs TFEB nuclear translocation and lysosome biogenesis upon DNA damage. Functionally, the RHEB phosphorylation-dependent TFEB response is required for proliferative recovery following genotoxic stress. These findings uncover an ATM-RHEB-mTORC1-TFEB signaling axis that links DNA damage to selective mTORC1 outputs, revealing a mechanism that enables cells to adapt to genotoxic cues.
| Item Type: | Thesis (PhD thesis) |
| Translated abstract: | Abstract Language Zellen können sich dynamisch an veränderte Umweltbedingungen anpassen, indem sie Signalkaskaden regulieren um das Zellwachstum, ihren Stoffwechsel und die Genomintegrität zu kontrollieren. Die DNA-Schadensantwort (DDR) und die mTORC1-Signalwege steuern jeweils die DNA-Reparatur und das Zellwachstum, aber wie sich diese Signalwege miteinander verknüpft sind, ist bis heute nicht vollständig geklärt. In dieser Arbeit identifizieren wir RHEB, einen direkten mTORC1-Aktivator, als Substrat der DDR-Kinase ATM. Interessanterweise stellen wir fest, dass, genotoxischer Stress die mTORC1-Aktivität unterschiedlich reguliert. Zum einem wird die Phosphorylierung des lysosomalen mTORC1 Substrats TFEB reduziert und gleichzeitig die Phosphorylierung des zytoplasmatischen Substrats S6K verstärkt. Die DDR-induzierte Phosphorylierung von RHEB steuert jedoch speziell den lysosomalen mTORC1-Signalweg. Die Verhinderung der RHEB-Phosphorylierung beeinträchtigt die nukleäre Translokation von TFEB und die Lysosomenbiogenese bei DNA-Schäden. Funktionell ist die RHEB-Phosphorylierungs-abhängige TFEB-Regulation für die proliferative Erholung nach genotoxischem Stress erforderlich. Diese Ergebnisse decken erstmals eine ATM-RHEB-mTORC1-TFEB-Signalachse auf, die DNA-Schäden mit selektiven mTORC1-Ausgaben verbindet und einen Mechanismus offenbart, der es Zellen ermöglicht, sich an genotoxische Signale anzupassen. German |
| Creators: | Creators Email ORCID ORCID Put Code |
| URN: | urn:nbn:de:hbz:38-804934 |
| Date: | 2026 |
| Language: | English |
| Faculty: | Faculty of Mathematics and Natural Sciences |
| Divisions: | Außeruniversitäre Forschungseinrichtungen > MPI for Biology of Ageing |
| Subjects: | Life sciences |
| Uncontrolled Keywords: | Keywords Language mTORC1 signaling, RHEB GTPase, ATM, TFEB/TFE3, DNA damage response (DDR) UNSPECIFIED |
| Date of oral exam: | 25 November 2025 |
| Referee: | Name Academic Title Demetriades, Constantinos Dr. Frezza, Christian Prof. Dr. |
| Refereed: | Yes |
| URI: | http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/80493 |
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https://orcid.org/0009-0003-7443-5621