Xanthopoulou, Kyriaki ORCID: 0000-0001-8591-8184, Imirzalioglu, Can, Walker, Sarah, V, Behnke, Michael, Dinkelacker, Ariane G., Eisenbeis, Simone, Gastmeier, Petra, Goelz, Hanna, Kaeding, Nadja, Kern, Winfried, V, Kola, Axel, Kramme, Evelyn, Lucassen, Kai, Mischnik, Alexander, Peter, Silke, Rohde, Anna M., Rupp, Jan ORCID: 0000-0001-8722-1233, Tacconelli, Evelina, Tobys, David, Vehreschild, Maria J. G. T., Wille, Julia, Seifert, Harald and Higgins, Paul G. (2022). Surveillance and Genomic Analysis of Third-Generation Cephalosporin-Resistant and Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae Complex in Germany. Antibiotics-Basel, 11 (10). BASEL: MDPI. ISSN 2079-6382
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To analyse the epidemiology and population structure of third-generation cephalosporin-resistant (3GCR) and carbapenem-resistant (CR) Klebsiella pneumoniae complex isolates, patients were screened for rectal colonisation with 3GCR/CR K. pneumoniae complex on admission to six German university hospitals (2016-2019). Also collected were 3GCR/CR and susceptible K. pneumoniae isolates from patients with bloodstream infections (2016-2018). Whole-genome sequencing was performed followed by multilocus sequencing typing (MLST), core-genome MLST, and resistome and virulome analysis. The admission prevalence of 3GCR K. pneumoniae complex isolates during the 4-year study period was 0.8%, and 1.0 bloodstream infection per 1000 patient admissions was caused by K. pneumoniae complex (3GCR prevalence, 15.1%). A total of seven K. pneumoniae complex bloodstream isolates were CR (0.8%). The majority of colonising and bloodstream 3GCR isolates were identified as K. pneumoniae, 96.7% and 98.8%, respectively; the remainder were K. variicola and K. quasipneumoniae. cgMLST showed a polyclonal population of colonising and bloodstream isolates, which was also reflected by MLST and virulome analysis. CTX-M-15 was the most prevalent extended-spectrum beta-lactamase, and 29.7% of the colonising and 48.8% of the bloodstream isolates were high-risk clones. The present study provides an insight into the polyclonal 3GCR K. pneumoniae population in German hospitals.
Item Type: | Journal Article | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creators: |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:38-694202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DOI: | 10.3390/antibiotics11101286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Journal or Publication Title: | Antibiotics-Basel | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Volume: | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number: | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Date: | 2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publisher: | MDPI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Place of Publication: | BASEL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ISSN: | 2079-6382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Language: | English | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Faculty: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Divisions: | Unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subjects: | no entry | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uncontrolled Keywords: |
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URI: | http://kups.ub.uni-koeln.de/id/eprint/69420 |
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